Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT1Q16394 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT1Q16394 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EXT1Q16394 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
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