Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMA4Q16363 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMA4Q16363 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA4Q16363 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms