Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VPS72Q15906 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VPS72Q15906 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
VPS72Q15906 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
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