Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGN3Q15651 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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