Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT3Q15649 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNHIT3Q15649 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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