Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIP13Q15645 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIP13Q15645 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIP13Q15645 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms