Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDSNQ15517 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDSNQ15517 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDSNQ15517 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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