Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC3Q15034 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERC3Q15034 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC3Q15034 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC3Q15034 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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