Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHPRHQ149N8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHPRHQ149N8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
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