Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO1Q147U7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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