Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDC1Q14676 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MDC1Q14676 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MDC1Q14676 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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