Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEDD9Q14511 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD9Q14511 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD9Q14511 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD9Q14511 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD9Q14511 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD9Q14511 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD9Q14511 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD9Q14511 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD9Q14511 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEDD9Q14511 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD9Q14511 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD9Q14511 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD9Q14511 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD9Q14511 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD9Q14511 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD9Q14511 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD9Q14511 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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