Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARB2Q14108 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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