Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBFBQ13951 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFBQ13951 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBFBQ13951 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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