Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H3Q13889 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H3Q13889 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2H3Q13889 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H3Q13889 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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