Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK1Q13546 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK1Q13546 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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