Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRQ13535 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRQ13535 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRQ13535 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRQ13535 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRQ13535 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRQ13535 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRQ13535 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRQ13535 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRQ13535 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRQ13535 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRQ13535 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRQ13535 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRQ13535 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRQ13535 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRQ13535 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRQ13535 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATRQ13535 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATRQ13535 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATRQ13535 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATRQ13535 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRQ13535 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRQ13535 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRQ13535 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRQ13535 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATRQ13535 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATRQ13535 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRQ13535 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRQ13535 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRQ13535 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRQ13535 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRQ13535 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRQ13535 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRQ13535 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRQ13535 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRQ13535 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRQ13535 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRQ13535 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRQ13535 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRQ13535 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRQ13535 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRQ13535 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRQ13535 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRQ13535 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRQ13535 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRQ13535 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRQ13535 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRQ13535 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRQ13535 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRQ13535 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRQ13535 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRQ13535 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRQ13535 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRQ13535 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRQ13535 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRQ13535 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRQ13535 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRQ13535 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRQ13535 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRQ13535 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRQ13535 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRQ13535 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRQ13535 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRQ13535 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRQ13535 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRQ13535 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRQ13535 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRQ13535 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRQ13535 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRQ13535 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRQ13535 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRQ13535 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRQ13535 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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