Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 LINC01146-205ENST00000556673 1182 ntTSL 35.2□□□□□ -1.587e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.597e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 SDF2-210ENST00000592250 1025 ntTSL 25.11□□□□□ -1.597e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 LINC01146-201ENST00000553496 425 ntTSL 34.93□□□□□ -1.627e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-212ENST00000518306 755 ntTSL 54.53□□□□□ -1.687e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-205ENST00000469238 423 ntTSL 24.27□□□□□ -1.737e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.737e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-223ENST00000522349 531 ntTSL 54.2□□□□□ -1.747e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.767e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ATF7IP2-215ENST00000568027 3406 ntTSL 1 (best)4.03□□□□□ -1.767e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 CTDSPL-208ENST00000486978 609 ntTSL 33.95□□□□□ -1.787e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-228ENST00000523927 556 ntTSL 43.67□□□□□ -1.827e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 LINC01146-202ENST00000553929 413 ntTSL 33.48□□□□□ -1.857e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-203ENST00000466029 223 ntTSL 33.12□□□□□ -1.917e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.017e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.197e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.227e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-215ENST00000567074 884 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.497e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.537e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.547e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 510.89□□□□□ -0.677e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 510.82□□□□□ -0.687e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.727e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.87e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.917e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 UBE2I-214ENST00000566775 396 ntTSL 35.3□□□□□ -1.567e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.585e-8■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.015e-8■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 214.27□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 213.96□□□□□ -0.187e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-207ENST00000478237 827 ntTSL 213.92□□□□□ -0.187e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-212ENST00000485976 1016 ntTSL 513.92□□□□□ -0.187e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.27e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-218ENST00000606525 2010 ntTSL 213.52□□□□□ -0.247e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 513.07□□□□□ -0.327e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.327e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-209ENST00000483813 1277 ntTSL 512.43□□□□□ -0.427e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 512.14□□□□□ -0.477e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-208ENST00000480994 732 ntTSL 510.44□□□□□ -0.747e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-204ENST00000463246 766 ntTSL 310.23□□□□□ -0.777e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 58.89□□□□□ -0.997e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 58.89□□□□□ -0.997e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.113e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 57.91□□□□□ -1.143e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 57.83□□□□□ -1.163e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.94□□□□□ -1.33e-7■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 313.49□□□□□ -0.253e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 511.21□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 PDXK-213ENST00000472777 460 ntTSL 57.01□□□□□ -1.293e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 55.99□□□□□ -1.453e-6■■■■□ 19.4
SRSF9Q13242 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.754e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.414e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.494e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.494e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.644e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.874e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AFDN-221ENST00000511637 5999 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.974e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)8.75□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AFDN-217ENST00000507679 670 ntTSL 34.89□□□□□ -1.634e-7■■■■□ 19.3
SRSF9Q13242 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 19
SRSF9Q13242 AC009120.2-203ENST00000565313 539 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.512e-6■■■□□ 19
SRSF9Q13242 TMEM120B-201ENST00000342607 2766 ntTSL 217.31■□□□□ 0.367e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.227e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.017e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.047e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.057e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.077e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-210ENST00000602821 544 ntTSL 414.21□□□□□ -0.137e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.167e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-209ENST00000561714 792 ntTSL 314.02□□□□□ -0.177e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.187e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.227e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MGAT4B-211ENST00000520019 831 ntTSL 313.66□□□□□ -0.227e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MGAT4B-212ENST00000520134 592 ntTSL 313.66□□□□□ -0.227e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 513.66□□□□□ -0.227e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.287e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MGAT4B-208ENST00000519616 522 ntTSL 513.19□□□□□ -0.37e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 PDXK-215ENST00000476313 1704 ntTSL 313.12□□□□□ -0.317e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MTERF3-202ENST00000517720 412 ntTSL 313.1□□□□□ -0.317e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-210ENST00000562171 707 ntTSL 312.99□□□□□ -0.337e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.337e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 212.87□□□□□ -0.357e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-213ENST00000602945 805 ntTSL 512.7□□□□□ -0.387e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 212.45□□□□□ -0.427e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.3□□□□□ -0.447e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.447e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.457e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.477e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-207ENST00000602622 2526 ntTSL 212.06□□□□□ -0.487e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.487e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.497e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 UBE2I-212ENST00000566159 2642 nt11.94□□□□□ -0.57e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-212ENST00000602860 1858 ntTSL 511.88□□□□□ -0.517e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-209ENST00000602780 579 ntTSL 211.82□□□□□ -0.527e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.537e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.547e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MGAT4B-203ENST00000518168 1013 ntTSL 211.66□□□□□ -0.547e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.557e-6■■■□□ 18.9
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