Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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