Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECH1Q13011 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECH1Q13011 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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