Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4Q12950 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4Q12950 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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