Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN2Q12907 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMAN2Q12907 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMAN2Q12907 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMAN2Q12907 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN2Q12907 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN2Q12907 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN2Q12907 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN2Q12907 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN2Q12907 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMAN2Q12907 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
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