Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP53BP1Q12888 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP53BP1Q12888 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53BP1Q12888 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
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