Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NCBP1Q09161 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NCBP1Q09161 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NCBP1Q09161 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP1Q09161 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP1Q09161 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP1Q09161 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCBP1Q09161 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP1Q09161 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP1Q09161 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP1Q09161 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP1Q09161 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCBP1Q09161 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCBP1Q09161 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NCBP1Q09161 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP1Q09161 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP1Q09161 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP1Q09161 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP1Q09161 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP1Q09161 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP1Q09161 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP1Q09161 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCBP1Q09161 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP1Q09161 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP1Q09161 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP1Q09161 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP1Q09161 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCBP1Q09161 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCBP1Q09161 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms