Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPARAQ07869 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPARAQ07869 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms