Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDSRQ06136 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDSRQ06136 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms