Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RELQ04864 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RELQ04864 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RELQ04864 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RELQ04864 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RELQ04864 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RELQ04864 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RELQ04864 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELQ04864 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELQ04864 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELQ04864 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELQ04864 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELQ04864 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELQ04864 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELQ04864 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELQ04864 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELQ04864 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELQ04864 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELQ04864 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELQ04864 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELQ04864 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELQ04864 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELQ04864 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELQ04864 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELQ04864 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELQ04864 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELQ04864 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELQ04864 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELQ04864 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELQ04864 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELQ04864 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELQ04864 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELQ04864 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELQ04864 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELQ04864 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELQ04864 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RELQ04864 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELQ04864 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELQ04864 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELQ04864 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELQ04864 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELQ04864 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELQ04864 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELQ04864 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELQ04864 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELQ04864 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RELQ04864 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELQ04864 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELQ04864 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELQ04864 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELQ04864 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELQ04864 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELQ04864 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELQ04864 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELQ04864 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELQ04864 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELQ04864 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RELQ04864 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELQ04864 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELQ04864 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELQ04864 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELQ04864 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELQ04864 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELQ04864 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELQ04864 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RELQ04864 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELQ04864 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELQ04864 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELQ04864 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RELQ04864 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELQ04864 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELQ04864 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELQ04864 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELQ04864 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELQ04864 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELQ04864 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELQ04864 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELQ04864 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELQ04864 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms