Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 TFB4YPR056W 1017 nt7.41□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 EXG2YDR261C 1689 nt7.41□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 ERP2YAL007C 648 nt7.4□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.4□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 SLD7YOR060C 774 nt7.4□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 YMR027WYMR027W 1413 nt7.4□□□□□ -1.22
CEF1Q03654 PLB3YOL011W 2061 nt7.4□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 TRR1YDR353W 960 nt7.39□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.39□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 LOT6YLR011W 576 nt7.39□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 DFR1YOR236W 636 nt7.39□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 YPR127WYPR127W 1038 nt7.39□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 ECM30YLR436C 3825 nt7.39□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 RMD8YFR048W 1989 nt7.39□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 DEF1YKL054C 2217 nt7.38□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 SPE4YLR146C 903 nt7.38□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 LDB7YBL006C 543 nt7.38□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 AVO2YMR068W 1281 nt7.38□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 SSC1YJR045C 1965 nt7.37□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 MSG5YNL053W 1470 nt7.36□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 IRS4YKR019C 1848 nt7.36□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 HXT15YDL245C 1704 nt7.36□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 HXT16YJR158W 1704 nt7.36□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 THR1YHR025W 1074 nt7.36□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 SLX5YDL013W 1860 nt7.36□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 CTA1YDR256C 1548 nt7.36□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 HPT1YDR399W 666 nt7.35□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 YOL099CYOL099C 492 nt7.35□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 YOR111WYOR111W 699 nt7.35□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 TOD6YBL054W 1578 nt7.34□□□□□ -1.23
CEF1Q03654 RIX7YLL034C 2514 nt7.33□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 SPG5YMR191W 1122 nt7.33□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 ASR1YPR093C 867 nt7.33□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 TDP1YBR223C 1635 nt7.33□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 MSS116YDR194C 1995 nt7.33□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 YPR076WYPR076W 375 nt7.32□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 NUP49YGL172W 1419 nt7.32□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 YBR284WYBR284W 2394 nt7.32□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 EMW1YNL313C 2715 nt7.31□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 PPH21YDL134C 1110 nt7.31□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 MED6YHR058C 888 nt7.31□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 KNS1YLL019C 2214 nt7.31□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 AGX1YFL030W 1158 nt7.3□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 HOC1YJR075W 1191 nt7.3□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 POB3YML069W 1659 nt7.29□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 MRPS28YDR337W 861 nt7.29□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 MIX17YMR002W 471 nt7.29□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 FCY22YER060W-A 1593 nt7.29□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 DLD1YDL174C 1764 nt7.28□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 YOR389WYOR389W 1875 nt7.28□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 PRI1YIR008C 1230 nt7.28□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 LIA1YJR070C 978 nt7.28□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 YBR113WYBR113W 483 nt7.28□□□□□ -1.24
CEF1Q03654 CRH1YGR189C 1524 nt7.27□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 PAP1YKR002W 1707 nt7.27□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 TRS31YDR472W 852 nt7.27□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 REC107YJR021C 945 nt7.27□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 PPS1YBR276C 2424 nt7.27□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 FMP40YPL222W 2067 nt7.26□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 IRC5YFR038W 2562 nt7.26□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 MSC3YLR219W 2187 nt7.26□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 ICP55YER078C 1536 nt7.26□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 LDB19YOR322C 2457 nt7.25□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 YCR041WYCR041W 333 nt7.25□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 YLR112WYLR112W 420 nt7.25□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 RPO26YPR187W 468 nt7.25□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 CYS4YGR155W 1524 nt7.25□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 MSS1YMR023C 1581 nt7.25□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 SLA2YNL243W 2907 nt7.24□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 ATG7YHR171W 1893 nt7.24□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 BNA5YLR231C 1362 nt7.24□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 NCS6YGL211W 1080 nt7.24□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 DPB2YPR175W 2070 nt7.24□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 HXT17YNR072W 1695 nt7.23□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 VPS72YDR485C 2388 nt7.23□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 YGL102CYGL102C 429 nt7.23□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 RDL2YOR286W 450 nt7.23□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 PTC7YHR076W 1032 nt7.22□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 FMO1YHR176W 1299 nt7.22□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 CYC8YBR112C 2901 nt7.22□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 MIP1YOR330C 3765 nt7.21□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 IVY1YDR229W 1362 nt7.21□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 CNM67YNL225C 1746 nt7.21□□□□□ -1.25
CEF1Q03654 YNL247WYNL247W 2304 nt7.21□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 PMP3YDR276C 168 nt7.21□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 ASF1YJL115W 840 nt7.21□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 TPK1YJL164C 1194 nt7.21□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 JJJ3YJR097W 519 nt7.21□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 YKL077WYKL077W 1179 nt7.21□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 YLL056CYLL056C 897 nt7.21□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 YHM2YMR241W 945 nt7.21□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 NTE1YML059C 5040 nt7.2□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 APM4YOL062C 1476 nt7.2□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 YER137CYER137C 447 nt7.2□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 SMX3YPR182W 261 nt7.2□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 RPL2BYIL018W 765 nt7.19□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 LSC1YOR142W 990 nt7.19□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 CHL4YDR254W 1377 nt7.19□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 ARO10YDR380W 1908 nt7.19□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 EMP65YER140W 1671 nt7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.5 ms