Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPCQ03188 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPCQ03188 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPCQ03188 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms