Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNFAIP2Q03169 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFAIP2Q03169 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP2Q03169 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms