Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHODHQ02127 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DHODHQ02127 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHODHQ02127 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms