Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDC42EP1Q00587 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC42EP1Q00587 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC42EP1Q00587 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 784.2 ms