Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL1Q00532 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL1Q00532 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL1Q00532 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms