Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX1P83916 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX1P83916 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX1P83916 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX1P83916 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX1P83916 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX1P83916 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX1P83916 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX1P83916 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX1P83916 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX1P83916 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX1P83916 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX1P83916 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX1P83916 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX1P83916 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX1P83916 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX1P83916 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX1P83916 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX1P83916 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX1P83916 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX1P83916 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX1P83916 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX1P83916 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX1P83916 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX1P83916 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX1P83916 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX1P83916 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX1P83916 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX1P83916 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX1P83916 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX1P83916 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX1P83916 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX1P83916 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX1P83916 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX1P83916 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX1P83916 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX1P83916 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX1P83916 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX1P83916 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX1P83916 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX1P83916 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX1P83916 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX1P83916 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX1P83916 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX1P83916 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX1P83916 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX1P83916 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX1P83916 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX1P83916 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX1P83916 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX1P83916 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX1P83916 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX1P83916 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX1P83916 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX1P83916 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX1P83916 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX1P83916 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX1P83916 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX1P83916 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX1P83916 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX1P83916 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX1P83916 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX1P83916 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX1P83916 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX1P83916 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX1P83916 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX1P83916 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX1P83916 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX1P83916 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX1P83916 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX1P83916 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX1P83916 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX1P83916 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX1P83916 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX1P83916 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX1P83916 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX1P83916 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX1P83916 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX1P83916 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX1P83916 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX1P83916 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX1P83916 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX1P83916 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX1P83916 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX1P83916 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX1P83916 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX1P83916 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX1P83916 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX1P83916 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms