Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG7P83436 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG7P83436 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG7P83436 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG7P83436 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG7P83436 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COG7P83436 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG7P83436 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG7P83436 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG7P83436 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG7P83436 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG7P83436 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG7P83436 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG7P83436 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG7P83436 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG7P83436 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG7P83436 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG7P83436 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG7P83436 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG7P83436 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG7P83436 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG7P83436 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG7P83436 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG7P83436 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG7P83436 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG7P83436 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COG7P83436 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG7P83436 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG7P83436 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG7P83436 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG7P83436 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG7P83436 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG7P83436 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COG7P83436 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG7P83436 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG7P83436 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COG7P83436 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG7P83436 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG7P83436 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG7P83436 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COG7P83436 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG7P83436 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG7P83436 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG7P83436 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG7P83436 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG7P83436 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG7P83436 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG7P83436 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG7P83436 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG7P83436 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG7P83436 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG7P83436 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG7P83436 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG7P83436 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG7P83436 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG7P83436 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COG7P83436 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG7P83436 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COG7P83436 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG7P83436 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG7P83436 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG7P83436 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG7P83436 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG7P83436 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG7P83436 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG7P83436 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG7P83436 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COG7P83436 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG7P83436 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG7P83436 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COG7P83436 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG7P83436 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG7P83436 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG7P83436 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG7P83436 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COG7P83436 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG7P83436 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG7P83436 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG7P83436 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG7P83436 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG7P83436 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG7P83436 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG7P83436 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG7P83436 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG7P83436 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG7P83436 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG7P83436 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG7P83436 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG7P83436 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG7P83436 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG7P83436 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms