Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX4P78413 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX4P78413 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX4P78413 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX4P78413 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX4P78413 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX4P78413 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX4P78413 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX4P78413 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX4P78413 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX4P78413 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX4P78413 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX4P78413 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX4P78413 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX4P78413 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX4P78413 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRX4P78413 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX4P78413 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX4P78413 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX4P78413 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX4P78413 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IRX4P78413 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX4P78413 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX4P78413 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX4P78413 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX4P78413 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX4P78413 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX4P78413 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX4P78413 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX4P78413 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRX4P78413 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX4P78413 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX4P78413 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX4P78413 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX4P78413 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRX4P78413 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX4P78413 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX4P78413 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX4P78413 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX4P78413 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX4P78413 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRX4P78413 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX4P78413 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRX4P78413 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX4P78413 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX4P78413 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRX4P78413 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX4P78413 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX4P78413 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRX4P78413 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX4P78413 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX4P78413 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX4P78413 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX4P78413 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRX4P78413 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX4P78413 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX4P78413 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX4P78413 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX4P78413 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX4P78413 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX4P78413 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX4P78413 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRX4P78413 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX4P78413 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX4P78413 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX4P78413 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX4P78413 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX4P78413 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX4P78413 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX4P78413 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRX4P78413 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX4P78413 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX4P78413 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRX4P78413 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX4P78413 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX4P78413 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX4P78413 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX4P78413 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX4P78413 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX4P78413 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX4P78413 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX4P78413 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRX4P78413 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX4P78413 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX4P78413 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRX4P78413 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX4P78413 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX4P78413 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX4P78413 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX4P78413 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX4P78413 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRX4P78413 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX4P78413 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX4P78413 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX4P78413 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX4P78413 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX4P78413 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX4P78413 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRX4P78413 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX4P78413 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms