Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23P62829 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23P62829 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23P62829 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23P62829 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23P62829 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23P62829 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23P62829 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23P62829 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23P62829 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23P62829 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23P62829 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23P62829 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23P62829 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23P62829 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL23P62829 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL23P62829 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23P62829 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23P62829 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23P62829 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23P62829 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23P62829 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23P62829 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23P62829 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23P62829 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23P62829 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23P62829 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23P62829 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23P62829 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23P62829 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23P62829 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23P62829 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23P62829 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23P62829 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23P62829 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23P62829 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23P62829 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23P62829 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23P62829 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23P62829 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23P62829 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23P62829 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23P62829 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23P62829 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23P62829 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23P62829 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23P62829 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL23P62829 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL23P62829 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23P62829 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23P62829 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23P62829 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23P62829 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23P62829 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23P62829 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23P62829 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23P62829 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23P62829 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23P62829 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23P62829 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23P62829 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23P62829 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23P62829 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23P62829 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23P62829 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23P62829 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23P62829 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23P62829 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23P62829 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23P62829 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23P62829 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23P62829 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23P62829 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23P62829 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23P62829 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23P62829 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23P62829 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23P62829 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23P62829 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23P62829 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23P62829 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms