Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO4P61968 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO4P61968 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO4P61968 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO4P61968 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO4P61968 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO4P61968 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO4P61968 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO4P61968 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO4P61968 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO4P61968 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO4P61968 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO4P61968 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO4P61968 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO4P61968 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO4P61968 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO4P61968 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO4P61968 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMO4P61968 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO4P61968 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO4P61968 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO4P61968 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO4P61968 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO4P61968 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO4P61968 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO4P61968 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO4P61968 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO4P61968 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO4P61968 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO4P61968 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO4P61968 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO4P61968 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO4P61968 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO4P61968 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO4P61968 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO4P61968 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO4P61968 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO4P61968 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO4P61968 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO4P61968 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO4P61968 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO4P61968 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO4P61968 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO4P61968 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO4P61968 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO4P61968 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO4P61968 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMO4P61968 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO4P61968 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMO4P61968 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO4P61968 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO4P61968 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO4P61968 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMO4P61968 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO4P61968 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO4P61968 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO4P61968 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMO4P61968 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO4P61968 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO4P61968 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO4P61968 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO4P61968 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO4P61968 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO4P61968 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO4P61968 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO4P61968 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO4P61968 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO4P61968 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO4P61968 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO4P61968 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO4P61968 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO4P61968 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO4P61968 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO4P61968 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO4P61968 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO4P61968 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO4P61968 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO4P61968 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO4P61968 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO4P61968 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO4P61968 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO4P61968 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO4P61968 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO4P61968 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO4P61968 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO4P61968 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO4P61968 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO4P61968 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO4P61968 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMO4P61968 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMO4P61968 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMO4P61968 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMO4P61968 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMO4P61968 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMO4P61968 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMO4P61968 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMO4P61968 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMO4P61968 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMO4P61968 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMO4P61968 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms