Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS3AP61247 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS3AP61247 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS3AP61247 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms