Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2MP61081 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UBE2MP61081 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2MP61081 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms