Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME5P56597 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME5P56597 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME5P56597 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME5P56597 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME5P56597 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME5P56597 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME5P56597 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NME5P56597 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME5P56597 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME5P56597 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME5P56597 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME5P56597 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME5P56597 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME5P56597 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME5P56597 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME5P56597 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NME5P56597 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NME5P56597 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME5P56597 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME5P56597 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME5P56597 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME5P56597 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME5P56597 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME5P56597 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME5P56597 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NME5P56597 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME5P56597 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME5P56597 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME5P56597 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME5P56597 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME5P56597 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME5P56597 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NME5P56597 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME5P56597 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME5P56597 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME5P56597 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME5P56597 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME5P56597 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME5P56597 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME5P56597 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME5P56597 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME5P56597 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME5P56597 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME5P56597 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME5P56597 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME5P56597 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME5P56597 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME5P56597 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME5P56597 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME5P56597 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NME5P56597 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME5P56597 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME5P56597 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME5P56597 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME5P56597 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME5P56597 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME5P56597 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME5P56597 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME5P56597 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME5P56597 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME5P56597 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME5P56597 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME5P56597 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME5P56597 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME5P56597 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME5P56597 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME5P56597 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME5P56597 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME5P56597 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME5P56597 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME5P56597 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME5P56597 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME5P56597 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME5P56597 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME5P56597 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME5P56597 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME5P56597 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME5P56597 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME5P56597 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME5P56597 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME5P56597 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME5P56597 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME5P56597 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME5P56597 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME5P56597 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME5P56597 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME5P56597 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME5P56597 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME5P56597 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME5P56597 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME5P56597 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME5P56597 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME5P56597 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME5P56597 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME5P56597 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME5P56597 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NME5P56597 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME5P56597 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME5P56597 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms