Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV3P56539 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV3P56539 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV3P56539 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV3P56539 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV3P56539 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV3P56539 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV3P56539 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV3P56539 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV3P56539 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV3P56539 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV3P56539 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV3P56539 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV3P56539 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV3P56539 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV3P56539 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV3P56539 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV3P56539 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV3P56539 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV3P56539 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV3P56539 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV3P56539 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV3P56539 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV3P56539 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV3P56539 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV3P56539 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV3P56539 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV3P56539 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAV3P56539 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAV3P56539 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV3P56539 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV3P56539 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV3P56539 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV3P56539 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV3P56539 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV3P56539 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV3P56539 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV3P56539 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV3P56539 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV3P56539 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV3P56539 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV3P56539 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAV3P56539 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV3P56539 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV3P56539 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV3P56539 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAV3P56539 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV3P56539 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV3P56539 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAV3P56539 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV3P56539 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV3P56539 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV3P56539 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV3P56539 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV3P56539 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV3P56539 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV3P56539 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV3P56539 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAV3P56539 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV3P56539 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV3P56539 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAV3P56539 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAV3P56539 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV3P56539 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV3P56539 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV3P56539 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV3P56539 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV3P56539 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV3P56539 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV3P56539 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV3P56539 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV3P56539 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV3P56539 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV3P56539 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV3P56539 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV3P56539 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV3P56539 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV3P56539 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV3P56539 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV3P56539 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV3P56539 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV3P56539 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV3P56539 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV3P56539 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV3P56539 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV3P56539 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV3P56539 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV3P56539 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV3P56539 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV3P56539 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV3P56539 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV3P56539 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV3P56539 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV3P56539 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV3P56539 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV3P56539 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV3P56539 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV3P56539 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV3P56539 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV3P56539 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms