Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP1S2P56377 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AP1S2P56377 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP1S2P56377 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP1S2P56377 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP1S2P56377 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP1S2P56377 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP1S2P56377 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP1S2P56377 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP1S2P56377 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP1S2P56377 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AP1S2P56377 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms