Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA1P56159 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA1P56159 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA1P56159 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA1P56159 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms