Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D1P54289 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D1P54289 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA2D1P54289 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms