Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 36.75□□□□□ -1.333e-9■■■■■ 50.5
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SUB1P53999 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 50.5
SUB1P53999 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-205ENST00000504789 570 ntTSL 414.57□□□□□ -0.082e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-213ENST00000515355 771 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -12e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-209ENST00000511615 1658 ntTSL 1 (best)7.7□□□□□ -1.182e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.292e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-204ENST00000504016 509 ntTSL 32.29□□□□□ -2.042e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.172e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 ACADM-211ENST00000528016 546 ntTSL 412.9□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 ACADM-205ENST00000481374 666 ntTSL 33.45□□□□□ -1.862e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.42e-9■■■■■ 50.3
SUB1P53999 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 50.3
SUB1P53999 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-18■■■■■ 50.3
SUB1P53999 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-18■■■■■ 50.3
SUB1P53999 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.262e-18■■■■■ 50.3
SUB1P53999 UBE2E1-205ENST00000452012 1166 ntTSL 34.85□□□□□ -1.632e-18■■■■■ 50.3
SUB1P53999 BCAT1-205ENST00000539282 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.96e-17■■■■■ 50.2
SUB1P53999 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.396e-17■■■■■ 50.2
SUB1P53999 BCAT1-207ENST00000543099 568 ntTSL 42.5□□□□□ -2.016e-17■■■■■ 50.2
SUB1P53999 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.98e-10■■■■■ 50.2
SUB1P53999 TOP2A-202ENST00000577541 420 ntTSL 21.14□□□□□ -2.238e-10■■■■■ 50.2
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SUB1P53999 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 49.7
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SUB1P53999 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-10■■■■■ 49.7
SUB1P53999 EIF2B2-201ENST00000266126 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.87e-10■■■■■ 49.7
SUB1P53999 EIF2B2-207ENST00000556668 1011 ntTSL 26.31□□□□□ -1.47e-10■■■■■ 49.7
SUB1P53999 KDM1A-203ENST00000465864 568 ntTSL 56.25□□□□□ -1.417e-9■■■■■ 49.7
SUB1P53999 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 05e-9■■■■■ 49.6
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SUB1P53999 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.856e-9■■■■■ 49.6
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SUB1P53999 RPL35A-202ENST00000429437 442 ntTSL 53.66□□□□□ -1.826e-9■■■■■ 49.6
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SUB1P53999 PSMD9-204ENST00000537407 1195 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.11e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 49.5
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SUB1P53999 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-10■■■■■ 49.5
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SUB1P53999 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 49.5
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SUB1P53999 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.851e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.911e-10■■■■■ 49.5
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SUB1P53999 ANKHD1-EIF4EBP3-202ENST00000474060 5446 ntTSL 25.4□□□□□ -1.551e-10■■■■■ 49.5
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SUB1P53999 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.631e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.71e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 SMG8-206ENST00000582469 1144 ntTSL 53.45□□□□□ -1.861e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 WDR12-204ENST00000467777 482 ntTSL 23.39□□□□□ -1.871e-10■■■■■ 49.5
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SUB1P53999 KYAT3-201ENST00000260508 2070 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 49.3
SUB1P53999 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 49.3
SUB1P53999 KYAT3-204ENST00000446900 1937 ntTSL 51.62□□□□□ -2.151e-7■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-204ENST00000425198 6952 ntTSL 55.75□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.641e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.021e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 49.2
SUB1P53999 GART-206ENST00000424203 3571 ntTSL 1 (best)6.24□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 49.2
SUB1P53999 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 49.2
SUB1P53999 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 49.2
SUB1P53999 SRSF7-201ENST00000313117 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.018e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-206ENST00000431066 1847 ntTSL 58.68□□□□□ -1.028e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-208ENST00000443213 1903 ntTSL 58.29□□□□□ -1.088e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.18e-32■■■■■ 49
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SUB1P53999 SRSF7-204ENST00000425778 2857 ntTSL 26.87□□□□□ -1.318e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.528e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-207ENST00000432873 603 ntTSL 33.01□□□□□ -1.938e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-211ENST00000477635 680 ntTSL 22.48□□□□□ -2.018e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-210ENST00000452806 747 ntTSL 21.68□□□□□ -2.148e-32■■■■■ 49
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