Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A3P53794 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A3P53794 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A3P53794 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms