Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP5CP53041 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP5CP53041 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP5CP53041 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms