Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NDST1P52848 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDST1P52848 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NDST1P52848 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDST1P52848 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NDST1P52848 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDST1P52848 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDST1P52848 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDST1P52848 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDST1P52848 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDST1P52848 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDST1P52848 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST1P52848 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST1P52848 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST1P52848 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST1P52848 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST1P52848 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST1P52848 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST1P52848 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDST1P52848 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDST1P52848 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDST1P52848 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDST1P52848 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDST1P52848 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDST1P52848 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDST1P52848 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDST1P52848 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDST1P52848 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDST1P52848 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDST1P52848 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDST1P52848 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDST1P52848 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDST1P52848 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST1P52848 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST1P52848 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST1P52848 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST1P52848 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST1P52848 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDST1P52848 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDST1P52848 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NDST1P52848 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDST1P52848 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDST1P52848 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDST1P52848 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDST1P52848 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDST1P52848 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDST1P52848 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDST1P52848 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDST1P52848 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDST1P52848 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDST1P52848 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDST1P52848 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDST1P52848 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDST1P52848 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDST1P52848 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDST1P52848 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDST1P52848 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDST1P52848 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST1P52848 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST1P52848 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST1P52848 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST1P52848 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST1P52848 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST1P52848 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST1P52848 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST1P52848 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST1P52848 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST1P52848 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDST1P52848 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDST1P52848 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDST1P52848 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDST1P52848 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NDST1P52848 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST1P52848 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST1P52848 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST1P52848 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST1P52848 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST1P52848 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST1P52848 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST1P52848 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST1P52848 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST1P52848 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST1P52848 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST1P52848 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST1P52848 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST1P52848 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST1P52848 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST1P52848 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST1P52848 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST1P52848 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST1P52848 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST1P52848 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST1P52848 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST1P52848 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST1P52848 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST1P52848 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST1P52848 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST1P52848 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST1P52848 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST1P52848 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms