Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP11P51784 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP11P51784 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP11P51784 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP11P51784 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP11P51784 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP11P51784 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP11P51784 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP11P51784 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP11P51784 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP11P51784 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP11P51784 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP11P51784 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP11P51784 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP11P51784 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP11P51784 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP11P51784 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP11P51784 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP11P51784 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP11P51784 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP11P51784 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP11P51784 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP11P51784 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP11P51784 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP11P51784 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP11P51784 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP11P51784 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP11P51784 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP11P51784 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP11P51784 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP11P51784 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP11P51784 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP11P51784 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP11P51784 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP11P51784 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP11P51784 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP11P51784 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP11P51784 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP11P51784 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP11P51784 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP11P51784 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP11P51784 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP11P51784 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP11P51784 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP11P51784 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP11P51784 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP11P51784 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP11P51784 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP11P51784 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP11P51784 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP11P51784 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP11P51784 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP11P51784 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP11P51784 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP11P51784 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP11P51784 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP11P51784 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP11P51784 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP11P51784 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP11P51784 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP11P51784 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP11P51784 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP11P51784 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP11P51784 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP11P51784 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP11P51784 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP11P51784 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP11P51784 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP11P51784 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP11P51784 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP11P51784 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP11P51784 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP11P51784 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP11P51784 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP11P51784 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP11P51784 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP11P51784 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP11P51784 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP11P51784 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP11P51784 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms